это достаточно большие объемы данных получаться, реляционные базы данных плохо с такими объемами справляются, в плане времени выборки... за mssql не скажу, не имел опыта работы с ним, а вот mysql примерно на тех же объемах данных у меня месяца через три уже еле шевелился, не смотря на то, что необходимые поля для поиска по выборкам имели индексы
Я как то писал небольшой продуктик для архивации значений из opcda в mongodb, что то на уровне 10к тегов с плавающей точкой в секунду писалось. Узкое место где то между OPC DA и PyOPC было, подозреваю