Ставь шим 4+кГц и кондейчик
Элемент Пельтье перекачивает тепло с одной стороны на другую. Но у него очень хорошая теплопроводность. В момент когда ШИМ в "0" тепло идёт обратно. Граничный переход будет испытывать постоянные перепады и Пельтье махом здохнет. (Это я узнал почему даже пульсации больше 5% нельзя, не то что ШИМ)
А сгладить кондеем вообще стоит хоть пробовать пытаться, учитывая что их там будет 10 штук по 2-3А и общая мощность 200-300 Ватт?