у тебя там что-то не примонтировалось нормально походу
[   16.116133] cgroup: new mount options do not match the existing superblock, will be ignored

вывод mount | grep sd покажи

ХЗ вроде криминала вообще не видно

/dev/sda1 on / type ext4 (rw,relatime,errors=remount-ro,data=ordered)

Да это сообщение можно смело игнорить !

fstab вот

UUID=682acb47-a0cf-4261-a3e2-8f8f983498c7 /               ext4    errors=remount-ro 0       1
# swap was on /dev/sda5 during installation
#UUID=d2503529-b23b-4b12-9853-05de43e6ca18 none            swap    sw              0       0
/dev/fd0        /media/floppy0  auto    rw,user,noauto,exec,utf8 0       0
/dev/sda2 none swap sw 0 0

да я уже сообразил что там выше в ро корень перемонтировали перед шутдауном поэтому да

Это там чото в системд мутят =)
Можно игнорировать

вот я по этому и написал. что хрень какая то невидемая.

Значит надо рыть в другом месте . Иногда ведь висяк может быть такой, что в лог не успеет попасть ничего.

а у тебя там ниче не монтируется по сети?может нфс какой-нибудь
systemctl list-units --type mount | grep active

неа

root@Zabbix40:~# systemctl list-units --type mount | grep active
-.mount                       loaded active mounted /
dev-hugepages.mount           loaded active mounted Huge Pages File System
dev-mqueue.mount              loaded active mounted POSIX Message Queue File System
proc-sys-fs-binfmt_misc.mount loaded active mounted Arbitrary Executable File Formats File System
run-user-1000.mount           loaded active mounted /run/user/1000
sys-fs-fuse-connections.mount loaded active mounted FUSE Control File System
sys-kernel-debug.mount        loaded active mounted Debug File System
var-lib-lxcfs.mount           loaded active mounted /var/lib/lxcfs
8 loaded units listed. Pass --all to see loaded but inactive units, too.

так нагляднее

А на USB портах особенно USB3 ничего не висит?

можно переключить вывод логов в tty12 и смотреть в реальном времени

О кстати У тебя же zabbix там =) И mysql  я так понимаю ?

это виртуалка. в usb ничего не прокинуто

postgres