так и должно быть, показываются только части здания, если он из них состоит. а базовый building=yes только для тех кто не отображает 3D
Если я правильно помню, F4 не отображает контур building в тех местах где поверх него есть контуры building:part. Обрати внимание на скриншот - это единственный угол где building:part отсутствует. И он отображается. Либо продублируй стилобат с тегами building:part, либо сделай контур building чуть чуть с отступом наружу