как всё сложно. Я недавно обновлял федору через форматирование раздела и установку новой версии с нуля. Забэкапил /etc, все дела. Оказалось, что
1) ставить с нуля в несколько раз быстрее, чем обновлять.
2) из сбэкапленных файлов пока пригодился только /etc/fstab
3) после обновления сделал dnf install на тот софт, что вспомнил, и ещё немного после. И нормально — никаких списков не понадобилось