Есть какие то годные приложения для проверки/лечения hdd для федоры
На современных дисках даже victoria мало что дает, лучше смотреть на reallocated sector count в выводе смарта
Если диски старые (примерно 2007-2013 года), то можешь глянуть на badblocks
sudo badblocks -v /dev/sdb
Читает секторы с диска в RO
В конце покажет тебе отчет о том, сколько секторов is bad
Ворнинги про медленное чтение вроде бы пишет