А куПЦР позволяет детектить любую днк? Типа, универсальные праймеры.

И что такое 16С?

На днк, кодирующую 16S rRNA. Да, есть универсальные праймеры для бактерья

хм. а для него что-то удобное для развертки именно кластера, с нфс и шедулером? типа как aws parallelcluster или starcluster?

А для грибья? :)

Думаю что нет

Там its'ы можно взять. Но они более специфичные к группе

Спасибо!

да, в их доках предлагают с нуля самостоятельно :( https://cloud.yandex.ru/docs/solutions/testing/hpc-on-preemptible

Но вообще идея просто брать очень консервативную последовательность, которая есть у всех

Слышал дифирамбы в адрес http://gc3-uzh-ch.github.io/elasticluster/, но сам не имел дела

ну он тоже платформоспецифичный :( под amazon как раз тулов хватает. т.к. наш Ломоносов временно в ауте, я сегодня играюсь с портом своего софта в облака. И буквально с полинка развернул тестовый кластер со StarCluster на Amazon EC2 (а потом выяснил, что эта штука умерла в 2015. но до сих пор отлично работает!)

а когда решил уже в продакшен на 100 ядер, выяснилось, что там жесткие лимиты и их поднятие только через саппорт :(

народ, у кого-нибудь есть опыт с подготовкой изображений срезов тканей для скармливания нейросетям, для их обучения распознавать раковые клетки?

чатик, подскажи как "кросслинкинг коллагена" будет по-русски? В соответствии с нашими терминами

поперечные связи?

я бы скорее сказал кросс-сшивки

>биоинформатик
>Продакшн

если мне за результат платят деньги, то это продакшн. даже если он в коробке из под обуви :)

С клетками нет, с неросетями и картинками для них да.

в общем, на руках сканы тканей легких, там есть аденокарцинома, и нужно выделить наиболее характерные участки опухоли для распознавания расположения клеток нейросетью

Ну я на работе этим занимаюсь в том числе. Вам патолог нужен