Size: a a a

2020 February 26

G

German in Science FYI
Paulina D
ага, тогда теперь я понимаю, о чём речь :)

а что, например, можно делать с помощью статистикал лёрнин ин джиномикс?
(извините, если очень нубский вопрос, можете не отвечать)
скажем, у вас есть 100 образцов, в них измерены экспрессия генов, метилирование, точечные мутации, структурные вариации - задачу сведения этих данных в один датасет и совместную обработку для изучения корреляции скажем с ответом на терапию я вижу как задачу статистикал дженомикс
источник

PD

Paulina D in Science FYI
German
скажем, у вас есть 100 образцов, в них измерены экспрессия генов, метилирование, точечные мутации, структурные вариации - задачу сведения этих данных в один датасет и совместную обработку для изучения корреляции скажем с ответом на терапию я вижу как задачу статистикал дженомикс
ой, кажется, мне это может пригодиться.
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Спасибо!
источник

G

German in Science FYI
Paulina D
ой, кажется, мне это может пригодиться.
я работаю в клинике и ничего кроме клиники не знаю, но вот по-моему хороший пример где может пригодиться статистикал дженомикс (можно только картинки посмотреть) https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30302-7?utm_campaign=STMJ_1522958526_SC&utm_channel=WEB&utm_source=WEB&dgcid=STMJ_1522958526_SC
источник

IV

Ivan Valiev in Science FYI
German
ну...идея в том что участники школы должны знать статистику и иметь отдаленное представление о машинном обучении
А можно будет несколько более точные prerequisites?
Школа прям интригует, но хотелось бы иметь перечень того, что лучше повторить заранее (чтобы не быть верблюдом)
источник

G

German in Science FYI
Ivan Valiev
А можно будет несколько более точные prerequisites?
Школа прям интригует, но хотелось бы иметь перечень того, что лучше повторить заранее (чтобы не быть верблюдом)
все требования будут, я инсайды раздаю, с которыми команда не соглашалась =) скорее всего знание статистики на уровне этого курсеровского курса + навыки R или питон неплохие (думаю 5 из 10 пойдёт) + мотивация зачем это нужно и как дальше применять в научной жизни
источник

G

German in Science FYI
(или на уровне 2х курсов - там есть вторая часть)
источник

АС

Александр Смирнов... in Science FYI
German
товарищи ранний анонс - мы делаем школу по Statistical Learning in Genomics в конце июля (Варшава) и там же будет конференция по вычислительной биологии в целом (так как школе нашей 5 лет, типа, отметим юбилей) - https://ngschool.eu/ngschool2020/  - ай хайли рекомменд
А стоимость какая?
источник

G

German in Science FYI
Александр Смирнов
А стоимость какая?
пляшет вокруг 600-700 евро. но так как мы получаем веселый грант, 100 евро. конфа 100 евро для индустрии, 45 early bird academy
источник

M

Maria in Science FYI
German
товарищи ранний анонс - мы делаем школу по Statistical Learning in Genomics в конце июля (Варшава) и там же будет конференция по вычислительной биологии в целом (так как школе нашей 5 лет, типа, отметим юбилей) - https://ngschool.eu/ngschool2020/  - ай хайли рекомменд
Действительно интересно. А всякая Баесовская статистика и применение Марковских моделей входят?
Или это уже неинтерпретируемо?)
источник

G

German in Science FYI
Maria
Действительно интересно. А всякая Баесовская статистика и применение Марковских моделей входят?
Или это уже неинтерпретируемо?)
в прошлом году Байесовская была, Марковских моделей не было - в этом году скорее всего оба раздела войдут
источник

G

German in Science FYI
Марковские модели все-таки основаны на вполне себе параметрических предположениях и имхо очень даже интерпретируемо
источник

M

Maria in Science FYI
German
в прошлом году Байесовская была, Марковских моделей не было - в этом году скорее всего оба раздела войдут
Очень круто! Спасибо
источник

G

German in Science FYI
по поводу денег - всё это стоит денег, но с 2016го года у нас философия что это школа для восточной европы, поэтому мы каждый раз подаемся на грант. в прошлый раз вовремя грант не получили - школа была в ноябре. в этом году насколько я вижу препятствий получить грант нет. поэтому для участника цена 100 евро. не потому что Польша настолько дешевая XD
источник

G

German in Science FYI
Maria
Очень круто! Спасибо
я отмечу пожелания Марковских моделей в программе =)
источник

a

angelina in Science FYI
а прохождение квизов будет после окончания регистрации или сразу после подачи заявки?) чтобы оценить время на заполнение пробелов в знаниях :)
источник

G

German in Science FYI
имхо при регистрации уже. в прошлый раз регистрационная форма была рассчитана на 2-3 часа из-за квизов. по ним пробелы особо не увидишь - там довольно хитрые задачки были, где даже я пару раз не заметил прикола. тут либо знаешь либо нет....
источник

G

German in Science FYI
но вот была парадоксальная ситуация - некоторые участники с довольно хорошими результатами в квизе отмечали в отзывах "мы ничего не понимаем", а те у кого были средние результаты всё понимали. поэтому видимо секрет не читерить при заполнении - толку не будет)
источник

G

German in Science FYI
ну и мы постараемся чтобы уровень занятий точно отвечал уровню участников которые мы набираем
источник

S

Sasha in Science FYI
German
то есть дип лернингов, гауссовских процессов и прочих mcmcmc не будет - будет то что в 99% статьей по вычислительной биологии
а почему mcmc это черный ящик?
источник