LA
Меня интересует бактериальное сообщество
Size: a a a
2020 February 27
IV
Lolita Alekseeva
Протоколы там очевидны
Эм.
Все равно недостаточно деталей.
И да, протоколы далеко не всегда очевидны.
Все равно недостаточно деталей.
И да, протоколы далеко не всегда очевидны.
O
Lolita Alekseeva
Меня интересует бактериальное сообщество
Их чуть больше чем дофига разных. Изучать их можно тоже в разных аспектах
IV
Lolita Alekseeva
Меня интересует бактериальное сообщество
В смысле - разнообразие бактерий в разных экосистемах..?
LA
Их чуть больше чем дофига разных. Изучать их можно тоже в разных аспектах
В том-то и дело. Что мне не особо нужна конкретика. Меня интересует общее филогенетическое разнообразие в разных типах почв, возможно какая-то история, связанная с обводненными почвами.
VZ
Коллеги, кто на BGRS собирается? Этот жуткий abstract template меня с ума скоро сведет 😆 обязательно прямо каждого автора емейл указывать?
Еее, рад, что нравится
Да, всем нужно указать.
Да, всем нужно указать.
G
товарищи вопрос - есть такая метрика Identity By State, сравнивая двух человек, каждый биаллельный вариант может быть в состоянии 0, 1 или 2, и IBS это как часто состояния совпадают. почему IBS между родственниками может быть меньше чем между неродственными людьми? (в смысле не случайно, это систематический эффект)
S
German
товарищи вопрос - есть такая метрика Identity By State, сравнивая двух человек, каждый биаллельный вариант может быть в состоянии 0, 1 или 2, и IBS это как часто состояния совпадают. почему IBS между родственниками может быть меньше чем между неродственными людьми? (в смысле не случайно, это систематический эффект)
ого
систематический - это типа IBS в среднем больше между неродственниками, чем между родственниками?
систематический - это типа IBS в среднем больше между неродственниками, чем между родственниками?
G
ого
систематический - это типа IBS в среднем больше между неродственниками, чем между родственниками?
систематический - это типа IBS в среднем больше между неродственниками, чем между родственниками?
очень странная картина у меня получается + я не писал тул сам, а использую чужой - я и думаю ошибка это или нет
S
German
очень странная картина у меня получается + я не писал тул сам, а использую чужой - я и думаю ошибка это или нет
а шо за тул?
G
вот по y - Identitiy By State
G
облако сверху справа - это тот же самый человек или близнецы
G
облако чуть ниже но далеко от всего - это брат/сестра
G
облака слева - разные популяции, самое большое облако - расстояния между европейцами
G
а вот снизу справа что творится я не знаю
G
по-моему это второе колено (судя по shared genotype по оси x) - но не уверен
G
правда еще одна версия что тут дофига близкородственных скрещиваний
G
тут нужна мат модель конечно чтобы это понять :/ видимо придется считать самоу XD
S
German
тут нужна мат модель конечно чтобы это понять :/ видимо придется считать самоу XD
а как genomic overlap считался?
G
тоже по вариантам - какой процент вариантов совпадает между людьми