AZ
ну собственно и иллюмина бахвалится цифрами тоже не с секвенаторов в коробке из под обуви
Size: a a a
2020 February 28
G
как бы можно смеяться но анализ генома в Германии стоит под 2К евро - ибо человеки стоят денег (хотя роботов уже купили, роботов-врачей не завезли)
G
по ценам сказать ничего не смогу так как все эти соглашения держатся в секрете :/
G
я не имею права говорить какие цены предлагает иллюмина именно нам (<2000 евро как можно понять)
AZ
German
я не имею права говорить какие цены предлагает иллюмина именно нам (<2000 евро как можно понять)
в паблике, вроде, они говорят про 600 долларов?
G
в паблике, вроде, они говорят про 600 долларов?
такие числа звучали, помню
G
но самые клевые штуки имхо происходят с NGS-стартапами - там есть игроки которые (по мнению крутых профов не аффилиированных) могут отожрать солидный кусок
AZ
German
такие числа звучали, помню
Genome sequencing costs £6841 per cancer case (comprising matched tumor and germline samples) and £7050 per rare disease case (three samples). The consumables used during sequencing are the most expensive component of testing (68–72% of the total cost). Equipment costs are higher for rare disease cases, whereas consumable and staff costs are slightly higher for cancer cases.
AZ
G
единственное что обидно - что я сдал биотех и забыл, и вообще не понимаю как новые секвенаторы работают =(
G
Genome sequencing costs £6841 per cancer case (comprising matched tumor and germline samples) and £7050 per rare disease case (three samples). The consumables used during sequencing are the most expensive component of testing (68–72% of the total cost). Equipment costs are higher for rare disease cases, whereas consumable and staff costs are slightly higher for cancer cases.
нет ну они там просто офигели
O
German
вернее если ты точно знаешь что есть заболевание - гоняешь с семьей, если просто ищешь что-нибудь - лучше неродственные (иначе твои мутации могут быть замаскированы тем что они есть у твоих родственников и пайплайн скажет а не, всё норм, они есть у контрольных образцов тоже)
То есть можно в параллель тупо референсную сборку пустить? Или в чем прикол?
G
То есть можно в параллель тупо референсную сборку пустить? Или в чем прикол?
ну камон ты же сам занимаешься секвенированием, как можно сравнивать результат секвенирования (кучу коротких ридов) и строку длиной 3 гигабазы
O
German
как бы можно смеяться но анализ генома в Германии стоит под 2К евро - ибо человеки стоят денег (хотя роботов уже купили, роботов-врачей не завезли)
Это с анализом данных уже или пробоподготовка+сиквенс?
G
Это с анализом данных уже или пробоподготовка+сиквенс?
с анализом, да - но вот Артур нашел что в УК это 7000 и это конечно дичь
O
German
ну камон ты же сам занимаешься секвенированием, как можно сравнивать результат секвенирования (кучу коротких ридов) и строку длиной 3 гигабазы
Эээ, тип пайплайну надо дать две кучки ридов?
G
именно...
O
German
именно...
Все, теперь понял))
AZ
German
с анализом, да - но вот Артур нашел что в УК это 7000 и это конечно дичь
ну тут пара нюансов.
"was carried out from June 2016 to December 2017"
ну и да, это полный пайплайн, от забора образца до репорта и архивирования результатов.
"was carried out from June 2016 to December 2017"
ну и да, это полный пайплайн, от забора образца до репорта и архивирования результатов.
G
ну тут пара нюансов.
"was carried out from June 2016 to December 2017"
ну и да, это полный пайплайн, от забора образца до репорта и архивирования результатов.
"was carried out from June 2016 to December 2017"
ну и да, это полный пайплайн, от забора образца до репорта и архивирования результатов.
вот это я упустил - для того времени это норм, но зачем публиковать это в 2020 0.0