VK
Здравствуйте
Тут есть кто-то добрый и секущий в масс спектрометрии? Не белков
Была бы супер признательна, если бы можно было помучить кого-то вопросами
Size: a a a
2020 June 02
M
К
AB
Слушайте, кто юзает vlnplot? Там можно установить y.max, а вот минимум нигде не нахожу, правда так что ли?
MS
пробежавшись по коду я вижу что он возвращает ggplot объект
MS
так что VlnPlot(...) + scale_y_continuous("...", limits = c(ymin, ymax))
IC
так что VlnPlot(...) + scale_y_continuous("...", limits = c(ymin, ymax))
именно так, да
A
Соответственно, ylim()
AB
Соответственно, ylim()
Я тупенькая, но не настолько! =D
A
Не получается + ylim()?
AB
так что VlnPlot(...) + scale_y_continuous("...", limits = c(ymin, ymax))
Спасибо, щас попробую
AB
Не получается + ylim()?
Неа, ничего не меняет.
MS
короче, походу не совсем ggplot
MS
"Combine plots into a single patchworked ggplot object. If FALSE, return a list of ggplot objects"
MS
те если одна картинка то (VlnPlot(...), combine = F)[[1]] + ylim()
AB
Оба подхода работают, если я хочу визуализировать один ген, а ежли десять — то он ваще не реагирует на действия с осью 😡
AB
Но спасибо за подсказки!
MS
Оба подхода работают, если я хочу визуализировать один ген, а ежли десять — то он ваще не реагирует на действия с осью 😡
вот, я и говорю про patchwork
AB
вот, я и говорю про patchwork
Да, попробую с ним. Гениальный пакет канеш!
MS
когда несколько генов, ты можешь сделать combine = F, это даст тебе list из ggplot, каждому из которых ты можешь поставить лимиты, а потом завернуть обратно в patchwork