Телеграмм чат группы sci

ох, Вика, что ж у тебя за научник-то :/

Да отстой был, чего уж тут :( не от хорошей жизни истории про зомбо-профов появились

17:32пожаловаться #1

VP

Vasily Popkov in Science FYI

Viktoria Korzhova

Ну выходит быстрее, учитывая, что мы мою статью уже больше года мурыжим. Но зато тогда будешь с phd, но без статей (или с меньшим их количеством). В зависимости от выбранной карьерной траектории это может быть проблемой или не быть.
Ну и если уйдёшь из лабы, а стать всё ещё нужно будет опубликовать - это отдельный геморрой.

Кстати, иногда бывает и удобно. Например, у нас после защиты "убежала" аспирантка, не доделав статью.

Через какое-то время ее доделали без нее и еще первым автором поставили.

17:32пожаловаться #2

PD

Мне нужна помощь с установкой cellranger ((
@azkalot1 @abeliavskaia
конкретно с командой

$ export PATH=/opt/cellranger-4.0.0:$PATH

(это из официальной инструкции 10Х)
Она не работает как надо(( После применения этой команды (с изменением директории из примера opt на мою директорию, понятное дело) при попытке сделать что угодно, начинающееся с cellranger, оно возвращает, что command not found.
Как проверить, ЧЯДНТ?

17:33пожаловаться #3

VK

Но зато я теперь хороший советчик!
А то есть люди, которые сами говна не хлебнули, потому что им везло, и думают, что все лабы хорошие и нет ничего сложного в том, чтобы выбрать лабу...

17:33пожаловаться #4

А

Алексей in Science FYI

А где в Европах занимаются прикладной физикой и/или прочностью?

17:33пожаловаться #5

VK

Кстати, иногда бывает и удобно. Например, у нас после защиты "убежала" аспирантка, не доделав статью.

Через какое-то время ее доделали без нее и еще первым автором поставили.

Ну это везение, так далеко не всегда бывает

Александр Смирнов... in Science FYI

17:33пожаловаться #6

АС

Мне нужна помощь с установкой cellranger ((
@azkalot1 @abeliavskaia
конкретно с командой

$ export PATH=/opt/cellranger-4.0.0:$PATH

(это из официальной инструкции 10Х)
Она не работает как надо(( После применения этой команды (с изменением директории из примера opt на мою директорию, понятное дело) при попытке сделать что угодно, начинающееся с cellranger, оно возвращает, что command not found.
Как проверить, ЧЯДНТ?

Возможно, тут ещё может помочь @aozalevsky

17:34пожаловаться #7

VP

Vasily Popkov in Science FYI

Viktoria Korzhova

Ну это везение, так далеко не всегда бывает

Ну да. Наша лаба гипер дружелюбная.

С другой стороны, заставить сделать что-то после защиты анриал. Максимум - не включат в статью. Но это уже неприлично совсем. Я бы ожидал, что если забить, то человек уедет в недра списка авторов из начала.

17:34пожаловаться #8

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI

Мне нужна помощь с установкой cellranger ((
@azkalot1 @abeliavskaia
конкретно с командой

$ export PATH=/opt/cellranger-4.0.0:$PATH

(это из официальной инструкции 10Х)
Она не работает как надо(( После применения этой команды (с изменением директории из примера opt на мою директорию, понятное дело) при попытке сделать что угодно, начинающееся с cellranger, оно возвращает, что command not found.
Как проверить, ЧЯДНТ?

Добавь в .basrc, потом source .bashrc

17:35пожаловаться #9

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI

и сделай echo $PATH чтобы посмотреть, что у тебя в PATH лежит

17:35пожаловаться #10

VK

Ну да. Наша лаба гипер дружелюбная.

С другой стороны, заставить сделать что-то после защиты анриал. Максимум - не включат в статью. Но это уже неприлично совсем. Я бы ожидал, что если забить, то человек уедет в недра списка авторов из начала.

Часто могут на статью забить, особенно если это не тянет на высокий импакт

17:36пожаловаться #11

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI

Мне нужна помощь с установкой cellranger ((
@azkalot1 @abeliavskaia
конкретно с командой

$ export PATH=/opt/cellranger-4.0.0:$PATH

(это из официальной инструкции 10Х)
Она не работает как надо(( После применения этой команды (с изменением директории из примера opt на мою директорию, понятное дело) при попытке сделать что угодно, начинающееся с cellranger, оно возвращает, что command not found.
Как проверить, ЧЯДНТ?

алсо что показывает ls "твоя директория где селлранжер"?

17:36пожаловаться #12

VP

Vasily Popkov in Science FYI

Viktoria Korzhova

Часто могут на статью забить, особенно если это не тянет на высокий импакт

Ну да. Примерный эквивалент "не включат". Если валишь из академа, то может можно и смириться с таким. Степень дали...

17:36пожаловаться #13

PD

Sergey Kolchenko

алсо что показывает ls "твоя директория где селлранжер"?

cellranger-4.0.0      refdata-gex-GRCh38-2020-A         refdata-gex-mm10-2020-A.tar.gz

cellranger-4.0.0.tar  refdata-gex-GRCh38-2020-A.tar.gz

17:37пожаловаться #14

PD

Sergey Kolchenko

и сделай echo $PATH чтобы посмотреть, что у тебя в PATH лежит

сделала, а что там должно лежать?

17:38пожаловаться #15

VK

Ну да. Примерный эквивалент "не включат". Если валишь из академа, то может можно и смириться с таким. Степень дали...

да, потому я написала, что это зависит от карьерных планов. в целом, мне видится, что это добро, что можно защищаться без статей, просто нужно учитывать очевидные последствия.

17:39пожаловаться #16

L

Litto_ral in Science FYI

Ну да. Наша лаба гипер дружелюбная.

С другой стороны, заставить сделать что-то после защиты анриал. Максимум - не включат в статью. Но это уже неприлично совсем. Я бы ожидал, что если забить, то человек уедет в недра списка авторов из начала.

У нас тоже была такая аспирантка, и тоже получила первого автора все равно. Хотя у нас вот вообще не дружелюбная лаба так-то особо))

18:01пожаловаться #17

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI

сделала, а что там должно лежать?

А может проще поставить кондой? =) https://anaconda.org/hcc/cellranger

18:46пожаловаться #18

AB

Alex Beliavskaia in Science FYI

Мне нужна помощь с установкой cellranger ((
@azkalot1 @abeliavskaia
конкретно с командой

$ export PATH=/opt/cellranger-4.0.0:$PATH

(это из официальной инструкции 10Х)
Она не работает как надо(( После применения этой команды (с изменением директории из примера opt на мою директорию, понятное дело) при попытке сделать что угодно, начинающееся с cellranger, оно возвращает, что command not found.
Как проверить, ЧЯДНТ?

надо без бакса перед экспорт

18:47пожаловаться #19

PD

Alex Beliavskaia

надо без бакса перед экспорт

знаю, да)