A
А чем отправляли?
Size: a a a
2021 June 21
SS
Почта РФ у нас доставляла товар по России, из Германии я уже не помню, поскольку оформлял человек в Германии отправление. Могу уточнить.
MS
Пытаюсь вывести из R данные в текстовый файл через write.table, говорит "не могу перевести класс "phylo" в data.frame", что я делаю не так? Пытался другими командами вывести, все равно в жопу посылает
Я ньюфаг
Я ньюфаг
SK
Так видимо это формат дерева которы просто так не напинь. В R есть writeLines, попробуй
M
Ну phylo это не совсем текстовые данные. Что надо в целом сделать? Можно as.data.frame сначала кастануть
EP
попробуйте тут спросить: @rlang_ru
У вас объект из какого-то пакета, который не конвертируется в датафрейм. нужен либо пример, либо str() объекта.
У вас объект из какого-то пакета, который не конвертируется в датафрейм. нужен либо пример, либо str() объекта.
EP
это какие-то филогенетические деревья, они, судя по всему, так просто не конвертятся.
MS
У меня два пакета, один берет vcf, gff и дерево и создает из них объект с бинарными матрицами по снипам и генам, а второй должен по идее забирать объект первого и проводить с ним анализ. Но чет он не забирает, а причину понять у меня пока не хватает знаний в R, видимо надо маны почитать получше
И я попытался output первого в файл вытащить, но был послан
И я попытался output первого в файл вытащить, но был послан
M
А что пишет? Если совсем не получается можно лс
EP
у вас какие-то специфические пакеты, тут либо кто-то уже должен их знать, либо нужно ковыряться с минимальным примером кода.
MS
Нет подходящего метода для Ntip, применяемого к объекту класса list
MS
Да, наверное. Попробую разобраться пока сам, если не удастся, постучусь в канал, который вы скинули 🙂
DB
Нужно читать, что на вход Ntip можно
M
А какой там класс на входе должен быть? Сверху верно написали про минимальный пример кода (и пакеты надо написать какие используются)
DB
Объект phylo
M
as.phylo(объект) и усе тогда. Если у него кишки подходят
DB
Вывод из какой идёт функции?
MS
DB
Какая конкретно функция из первого? Что у неё в документации в разделе Value?
M
Ну и конкретный кусочек кода, где ошибка