А что вы планируете сделать?
Я бы, наверное, сделал для обоих фрагментов плавление, чтобы посмотреть, на какой температуре заканчивается пик одного и начинается другого. И если они достаточно узкие и не пересекаются, то, наверное, можно говорить, что на температуре между ними один фрагмент более или менее точно одноцепочечный, а второй - двуцепочечный