1. Закинуть в лягушку и еще до прогона ею выцепить урлы.
2. Скачать урлы из сайтмапа в txt и прогнать через сравнение текстов?
2а. Для более продвинутого уровня запилить их с excel и сравнить ВПРом?
1) Создаем новые файлы, убирая лишние данные, оставляем только <loc>URL</loc>
find /I "<loc>" sitemap1.xml > sitemap1.csv
find /I "<loc>" sitemap2.xml > sitemap2.csv
2)Открываем в Excel (sitemap1.csv,sitemap2.csv)
3)Вносим данные на одну страницу (в один столбец)
4)Отмечаем дубли через Conditional Formating (все дубли будут отмечены одним цветом)
Опять таки, это по быстрому по условию задачи (не зная для чего это делается, какие объемы и т.д.)