у меня была такая история, я сделал отчет по внутреннему трафику и реферерам, чтобы понять, какие страницы его дают. по итогу на всех страницах был код счетчика, в итоге так и не понял в чем дело
У меня было смешно. Проверила везде наличие счётчика, а номер не проверила. А надо было. Увольняющийся программист решил затестировать шаблон, подключив к нему свой счётчик. Искали потом с собаками.
Сколько шаблонов на сайте со страницами, куда направлен поисковый трафик? Обычно косяк на шаблоне. Вряд ли же к каждой странице прибивали счётчик гвоздями.