Вроде обновить счётчик недостаточно

И в первую очередь нужно дребезг устранять.

Pulse 1

Про дребезг сейчас речи не веду, однозначно потом буду возиться с ним. Сейчас хочется понять правильно ли работает алгоритм.

Что еще нужно не подскажите?

А в примерах нет подобного случая?

В it

Наверное в папке TIM надо смотреть, сейчас нет у меня возможности

Там может быть типа такого, что 1 импульс подался  после того, как счётчик достиг определенного значения, а потом не достаточно сбросить счётчик. Нужно таймер заново запустить. Это мое предположение, не знаю какая у вас ситуация

Типа как автоматической остановки может быть

Попробуйте заново таймер стартануть после сброса счётчика

Опишите подробнее что вы хотите

В IT есть такое: IS_TIM_32B_COUNTER_INSTANCE() Повторный старт таймера через HAL_TIM_PWM_Start не помог. Подробно, хочу следующее: 1) по внешнему меандру 50Гц ловить переход через ноль (первый раз после обнаружения перехода внешнего сигнала из логического нуля в единицу, второй раз после перехода из единицы в ноль). Потом с заданной задержкой (установку задержку хочу реализовать через кнопку) включать выход А, до наступления следующего перехода через 0 (далее откл. и повторение).

Сейчас таймер с такими настройками:

Т.е. сделать тот же меандр с задержкой?

Фазовый сдвиг

А какое значение у вас изначально записано в Counter Period ?

Не совсем. Заданный меандр с частотой 50Гц (период 20мс). А на выходе мне нужно получить 100Гц (период 10мс) изменяя длительность включения я так понимаю что это уже не меандр получается...