В первую очередь для настройки/проверки это удобнее, чем по аккаунтам скакать, а само наличие опции заодно снимает вопросы "почему у меня не работает".
А для реального модерирования зависит от условий применения ботов. Для grep/watchdog такой режим позволил бы поддерживать общую политику разрешенного/запрещенного, если групп и/или админов очень много. Гораздо проще настроить в боте запрещение чего-либо, чем обеспечить, чтобы о таком решении помнило несколько десятков админов.
Другое дело, что есть вопрос с безопасность такой опции. Обычно его решают в ботах доступностью подобных настроек только владельцу группы.