А pavu со мной согласен. До сброса настроек прыгает громкость высоко, а после сброса уже на низком уровне. При этом изменения значений в gui pavu никак не сказывается на pulse
Судя по всему, я смог исправить работу pulseaudio. Для этого потребовалось поставить графическую программу PulseEffects. Ещё на стадии установки звук улучшился, а потом она его и "закрепила". Не идеально, но хоть что-то