ну например gulp'ом можно после вебпака пройтись по чанкам и смержить их в куски нужного размера, а не как бог на душу положит. можно подрубить мощные шаблонизаторы для html, а не убогий htmlWebpackPlugin, можно иконки для сайта и манифеста сгенерировать, можно много чего сделать.