ну вот я тоже не совсем понимаю, зачем, например, я буду пихать Miranda NG в стор, если потом она всё равно будет обновляться сама, через стор по архитектурным причинам обновлять не вариант
не говоря уж о том, что в текущем инсталляторе InnoSetup юзер может выбрать компоненты, выбрать язык программы, который будет установлен, а в варианте со стором ему придётся потом через выбор компонентов внутри программы докачивать нужный язык
получится огромный комбайн с миллионом окон, а некоторые плагины исключают друг друга (например, список контактов может быть реализован 3 разными плагинами, следует выбрать один из них, а не три разом)