У тебя есть все права. Должно работать из коробки если git нормально настроен.
Дело не в правах на стороне гитхаб.
У меня доступ к гитхабу через SSH. Когда я делаю просто в консоли git clone, то у меня запрашивается пароль к SSH-ключу, я его ввожу и дальше все сливается.
А если я использую yiidevtool, то пароль он не запрашивает, а сразу пишет, что нет доступа.