Обязательства Сторон по контракту прекращаются с момента вступления в силу настоящего соглашения, за исключением гарантийных обязательств, указанных в разделе 5 контракта.
Если в такой форме изложить данный момент?
Да, я думаю, что именно так лучше и изложить. Гарантийные обязательства продолжают действовать и после расторжения договора, если иное не установлено соглашением сторон. Не укажите исключений, можно сказать, что откажитесь сами.