Я не вижу причин отказа, так как они участвуют как физ лица и прикладывают те же документы, что и для физ лиц, специальных норм в законе не установлено для них (44-ФЗ). И узнать об их спец системе налогообложения можно только на этапе подписания контракта, когда цену будут выяснять, с НДС или без.