Оценку соответствия на что?
PS сорри, но правда не понял
Должен выйти методический документ взамен "Мер защиты информации в ГИС" - общий для всех приказов (ага, уже больше года обещают) На основе его требований (базовые меры плюс меры усилен плюс собственные меры защиты, если базовых недостаточно) пишете ТЗ на систему защиты. Испытания проводите на соответствие тем требованиям ТЗ, которые реализует испытываемое изделие.