Общее правило: если не знаете, куда именно обращаться, обрящайтесь в ФСТЭК. Если есть какая-то неоднозначносьт (у вас нет допуска к перечню, неясно, как трактовать формулировку в перечне, неочевидно, относится ли именно этот кусок информации к пункту перечня и т.п.), субъект направляет вопрос в ФСТЭК, а ФСТЭК - в межведдомственную комиссию по защите государственной тайны.
Перечни сведений подлежащих засекречиванию- закрытые документы (с грифом), следовательно получить ответы на вопросы, касающиеся этих перечней может только лицо, имеющее лицензию на работу с ГТ.