ок. в лине в мяте используется deb пакеты. это по сути архив с файлами. в лине у всего есть общие библиотеки , которые превращаются в зависимости , которые нужны для установки программы(например иконки для панели инструментов могут не входить в стандартный пакет а нужно их отдельно ставить). для уставки из реп используется или apt-get или локально gdebi . эти утилитки распаковывают deb и распихивуют внутрение файлы по местам. так же обращаются к службам если нужно( например прописать программу в меню).