Потому что ресурсы приходилось гнать с Урала-Сибири, наукой Прибалтика никогда особо не славилась
А наука была в Москве, Ленинграде, Киеве, Минске и.т.п. Инженеров выпускали, распределиться в Прибалтику было очень козырно. Плюс, насколько я знаю, у прибалтов был сильный уровень профессионально-технического обучения, что важно для точных отраслей.