Так это нормально, делаете бэкап перед тестами. Нам помогает сделать сначала образ системы с установленным софтом проверяем работоспособность-делаем бэкап, потом начинаем эксперименты, выполняем пару пунктов задуманного опять бэкапим и так постоянно, чтобы откатиться можно было ) а потом выбираем образ при котором останавливаемся и проверяем его стабильность. Это упрощает сильно, но это имеет смысл если у вас 3-4 образа ОС+ПО, тк сказать шаблоны подгоняем