тут как-то было обсуждение тулзов для диаграмм, нашел очень интересное приложение
https://terrastruct.com/ основные моменты, которые понравились:
1) можно делать "слои" (проваливаешься из самого верхнего уровня процесса глубже)
2) можно делать "сценарии" (например, как работает ручка POST /checkout)