Там получается сейчас так. Заказчик подсовывает эксель файл, оттуда в дерево влетает куча ресурсов. И если дерево не трогать, то даже отсортировано получается как надо. Но потом кто-нибудь передвигает пару ресурсов в дереве, и menuindex слетают, и получается, что циферки эти изначальные влияют на вывод на фронтенд, но в админке уже такой порядок ресурсов не увидеть.