В доках написано, что для программного доступа к кукам нужного домена, необходимо его добавить в Whitelist Domains. Потом из кода инициализировать const cookieJar = pm.cookies.jar(); и потом почистить куки этого домена можно cookieJar.clear(URL, callback (error));. Вроде все делаю как написано, но куки не чистятся.