Size: a a a

R (язык программирования)

2020 November 07

EP

Ed P in R (язык программирования)
Я вот смотрю описание GenVisR
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/GenVisR/inst/doc/Intro.html

GenVisR attempts to maintain a high degree of flexibility while leveraging the abilities of ggplot2

Я почти на 100% уверен, что можно либо графики пакета подкрутить, либо вытащить из графиков результаты ваших кластеризаций и придумать новую визуализацию.
источник

К

Кирилл in R (язык программирования)
Ed P
Я вот смотрю описание GenVisR
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/GenVisR/inst/doc/Intro.html

GenVisR attempts to maintain a high degree of flexibility while leveraging the abilities of ggplot2

Я почти на 100% уверен, что можно либо графики пакета подкрутить, либо вытащить из графиков результаты ваших кластеризаций и придумать новую визуализацию.
Вот тоже об этом думаю
источник

К

Кирилл in R (язык программирования)
Просто вдруг есть аналог попроще с более открытыми возможностями
источник

EP

Ed P in R (язык программирования)
Если здесь нет людей, кто решал подобные задачи, то для остальных контекст неясен. А поскольку в чате есть люди, которые хорошо умеют в ggplot, то можно задачу перевести в понятный контекст.

Например, "хочу кластеры другого цвета" или "почему шрифт на этом графике такой уродливый". Тогда вам больше людей сможет помочь, т.к. задача ясна и не надо понимать суть расчетов.
источник

PU

Philipp Upravitelev in R (язык программирования)
Ed P
Я вот смотрю описание GenVisR
http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/GenVisR/inst/doc/Intro.html

GenVisR attempts to maintain a high degree of flexibility while leveraging the abilities of ggplot2

Я почти на 100% уверен, что можно либо графики пакета подкрутить, либо вытащить из графиков результаты ваших кластеризаций и придумать новую визуализацию.
я посмотрел на него. это биокондуктор, хоть и в кишках к ggplot2 и gtables обращается
но разбираться в s4-классах та еще морока. да и там графики сложные, чисто по конструкции. сабплоты и все такое
а кастомизацию я при беглом чтении гитхаба не так чтобы явно увидел, где-то заныкана. :(
источник

PU

Philipp Upravitelev in R (язык программирования)
в общем да, я бы взял пакет и попробовал бы его пошатать. но надо быть готовым к долгому разбирательству, что где лежит и как с этим работать.
источник

АК

Артём Клевцов... in R (язык программирования)
Если там на выходе ggplot, то с ними потом можно все что угодно делать в плане кастоммзации оформления.
источник

FA

Farid AB in R (язык программирования)
Привет, кто-нибудь знает где найти вот эту книгу:
источник

FA

Farid AB in R (язык программирования)
harvey 1989 state space and unobserved component models pdf
источник

К

Кирилл in R (язык программирования)
Всем спасибо!
источник

AS

Alexander Semenov in R (язык программирования)
Farid AB
harvey 1989 state space and unobserved component models pdf
На http://gen.lib.rus.ec есть. Только 2004 года.
источник

FA

Farid AB in R (язык программирования)
не дает доступ(((
источник

AS

Alexander Semenov in R (язык программирования)
Ходите через Opera. Там встроенный VPN.
источник

FA

Farid AB in R (язык программирования)
Спасибо , Александр! почитаю пожалуй
источник

ЕТ

Евгений Томилов... in R (язык программирования)
Дамы и господа, у кого есть старая версия R, попробуйте запустить код, пожалуйста, он у вас выдаёт TRUE или FALSE?

v <- 1:1e5

system.time({
 
 x <- 0
 for (i in v) x[i] <- sqrt(v[i])

 
})

system.time({
 
 y <- sqrt(v)
 
})

identical(x, y)
источник

ЕТ

Евгений Томилов... in R (язык программирования)
Похоже. в старых версиях не было ошибки с округлением, которая есть в новых.
источник

ЕТ

Евгений Томилов... in R (язык программирования)
Если делаю all.equal(x, y), то выдаёт TRUE, но setdiff всё равно выдаёт разнящиеся элементы.
источник

EP

Ed P in R (язык программирования)
Так нельзя сравнивать. В дело же вступает машинное округление и перед identical надо явно округлить до нужной точности
источник

ЕТ

Евгений Томилов... in R (язык программирования)
Ed P
Так нельзя сравнивать. В дело же вступает машинное округление и перед identical надо явно округлить до нужной точности
Да, но в курсе на Степике лектор делает без округления.
источник

ЕТ

Евгений Томилов... in R (язык программирования)
Т.е. я понимаю, что округление играет роль.
источник