Некорректных вопросов у меня всегда есть=)
Например, как написать в Shiny-приложении файл ui.R на 500+ строк. Например, в php есть функция include, которая позволят просто вставить кусок кода по ссылке из файла.
Соответственно при разработке можно писать код частями и раскидывать по файлам, подключая в основном файле всего одной строчкой.
В доках по шайни все это описано. Можно сорсить код, можно в модули/пакеты заворачивать.
Есть клевая книжка Mastering shiny, там минимум три раздела посвящено динамическим элементам, внешним файлам и модулям
Если код для UI на 500+ строк, я бы еще посмотрел , нет ли там повторов. Возможно, какие-то куски проще в функции обернуть и потом вызывать