а, ну и у двух коннекторов к клику здесь принципиальная разница. Падасхауз использует http, RClickhouse использует tcp

да. и порты разные ... А в R можно заливать через http как в Пандахаузе?

в http порт можно вставить откуда угодно обычным curl'ом

Htpp убог по определению. Там вся информация превращается в строки. Все потеряно, возможны ошибки точности, с датами проблемы. С нативным интерфейсом нет проблем, надо КХ курить просто

Попробуйте другой драйвер - https://github.com/hannesmuehleisen/clickhouse-r, он только на Github есть. Использует http интерфейс, а не бинарный.

не тут даже одна таблица не загружается

А попробуйте совсем тупо:

chunksize = 20000
chunk_ind = seq_len(nrow(GAaud_h)) %/% chunksize
for(each_chunk in unique(chunk_ind)){
    chunk = GAaud_h[chunk_ind == each_chunk, ]
    dbWriteTable(con, "GAaud_hist", chunk, append=TRUE , row.names = TRUE)
}

Еще хотелось бы поглядеть на питоновский код, который успешно работает.

спасибо попробую сейчас
код питоновский рабочий тут https://pastebin.com/ZFEKzKYE
там чанки по 100 000 в последней строчке указан

А у вас какие данные - строковых переменных много?

тоже самое :(

Перевел с питона на R, но проверить возможности нет:

chunksize = 20000
chunk_ind = seq_len(nrow(GAaud_h)) %/% chunksize
for(each_chunk in unique(chunk_ind)){
    chunk = GAaud_h[chunk_ind == each_chunk, ]
    curr = tempfile()
    fwrite(chunk, file = curr, quote = TRUE, eol = "\n", qmethod = "escape", col.names = FALSE)
    chunk = readLines(curr, encoding = "UTF-8")
    chunk = paste(chunk, collapse = "\n")
    dbSendQuery(con, paste0("INSERT INTO GAaud_hist (", chunk, ") FORMAT CSV"))
}

А row.names точно TRUE должно быть? Вроде в питоне как раз наоборот

Загадочная ошибка... А если так? Двойные кавычки меняем на одинарные:

chunksize = 20000
chunk_ind = seq_len(nrow(GAaud_h)) %/% chunksize
for(each_chunk in unique(chunk_ind)){
    chunk = GAaud_h[chunk_ind == each_chunk, ]
    curr = tempfile()
    fwrite(chunk, file = curr, quote = TRUE, eol = "\n", qmethod = "escape", col.names = FALSE)
    chunk = readLines(curr, encoding = "UTF-8")
    chunk = gsub('"', "'", chunk, fixed = TRUE)
    chunk = paste(chunk, collapse = "\n")
    dbSendQuery(con, paste0("INSERT INTO GAaud_hist (", chunk, ") FORMAT CSV"))
}

в питоне я добавил специально столбец с уникальным индексом ( просто номер строки) в датафрейм GAaud_hist , чтобы Кликхауз использовал этот столбец как Индексный...

А в R датафрейм GAaud_hist не содержит такого столбца с уникальным индексом ( то есть я его не добавил) , поэтому в R нужен row.names = TRUE

в моем коде rownames не пишутся, так что тоже надо добавить столбец

это как-то можно сделать в data.table ?

Если у вас GAaud_hist изначально не data.table, а обычный data.frame, то:

GAaud_hist = data.table(GAaud_hist, keep.rownames = "index")

а можно в личку написать?