в том, что программно-аппаратные средства в том числе могут подлежать изменению в процессе изменения конфигурации, как и средства защиты в общем-то - и нет требований по проведению дополнительных аттестационных испытаний или полноценной переаттестации в этом случае. эти вопросы закрываются плановым контролем защищенности.
Если следовать Вашей логике, я получаю аттестат на систему, после чего говорю "а вот теперь у меня управление конфигурацией" и меняю вообще все ОТСС на те, которые считаю нужным, так?