проблема в том, что при публикации 1С создает темповый каталог с конфой, в нем файл *.1CD имеет верхний и нижний регистр букв в наименовании, но по ошибке можно сделать вывод что когда команда публикации пытается обращаться к файлам в темповом каталоге, она обращается в нижнем регистре