Если хочется один, то имеет смысл первым сделать какой-нибудь branchpythonoperator, в нём проводить проверку того, были ли уже экспортнуты данные для таблички (даги же должны быть идемпотентными, чтобы даже если метабаза исчезнет, данные не прогружались опять).
Лучше, наверное, всё же генерить отдельные даги на таблицы. В них тогда вместо branchpythonoperator-а будет shortcircuitoperator