Sibri
А смомощью чего их можно без стыков сгенерировать?
gdal_contour "рисует" до середины пикселя а потом на границе пикселя ставит точку параллельно или перпендикулярно той, что на середине. Как на рисунке.
Нужно генерировать контуры с запасом по площади, а потом отрезать лишнее. Т.е. для одного квадрата градус на градус склеивать 9 квадратов, а потом вырезать один из центра. Тогда стыки будут правильные.