O
Выглядит очень полезно, спасибо
Да, кд-хид классная вещь. Плюсую))
Size: a a a
2019 September 20
AB
Ну и тут, я подозреваю, не про выравнивание. На 177k у тебя так всё гэпами обрастёт, что никакого сигнала не останется.
Ну выровненная сильва так и выглядит)
O
Ну и тут, я подозреваю, не про выравнивание. На 177k у тебя так всё гэпами обрастёт, что никакого сигнала не останется.
Может они дофига консервативны и там половина дублей?
AB
Может они дофига консервативны и там половина дублей?
В 16С есть 9 консервативный кусков, там все более менее. Вариативные куски распидорашены на дикое количество гэпов.
AB
Ну выровненная сильва так и выглядит)
MR
Ты не знаешь, как сильва достигла своего выравнивания? Там же огромная база 16С
В сильве, насколько я понимаю, своя выравнивалка, SINA - она reference-based.
AB
В сильве, насколько я понимаю, своя выравнивалка, SINA - она reference-based.
А, посмотрю, спасибо
A
А как софт называется?) Чтобы в консоли прям визуализировать выравнивания множественные?
A
AZ
less ?)
AZ
этож все одна строка)
AP
less ?)
угу ))
A
Блин,тупануо
A
Спасибо))
AB
Это просто head -n100 на фаста файл
A
Да,точно,я туплю))
AB
AB
Вот, в сильве на 16С щас 695171 сиквенсов.
AZ
Вот, в сильве на 16С щас 695171 сиквенсов.
не, в лоб это решать, как делают типичные, даже массовые равнялки - это анрил. тем более у тебя там супергетерогенная выборка
AB
не, в лоб это решать, как делают типичные, даже массовые равнялки - это анрил. тем более у тебя там супергетерогенная выборка
Попробую разделить на таксономические группы и выровнять те, которые нужны