Как именно в секвенировании не очень знаю. Если хочется красивый график с усами, больше – лучше :) Но если просто прикинуть порядок, 3 может хватить

Да, я бы взял доступный бюджет и поделил бы на стоимость одного рнк сека

У нас просто обратная задача: хотим проверить очень большую панель миРНК. ПЦР выходит дорогим. Возникла гипотеза, что секвенировние в таком случае обойдётся дешевле. Собственно, пытаемся сейчас посчитать возможные затраты и сравнить)

Больше панель - жестче поправка на множественные сравнения + ожидаемый размер эффекта надо представлять, для различий в 1 стандартное отклонение и в 10 нужны разные количества репликатов

@iflyamer @science_boy German
Спасибо большое, добрые люди, всех благ вам и в карьере удачи побольше

Опять же, про миРНК точно не скажу, но вообще даже если и не дешевле (а вполне может быть дешевле!), но это вообще лучше секвенированием... В смысле, работы меньше, чем миллион кПЦРов ставить, да и данные как-то лучше - в смысле, вы вообще все молекулы увидите, а не только выбранные "от балды".

Ай от души красна девица, всегда рады помочь, и тебе удачи на нелегком научном пути

— Как мидии заражают друг друга раком?
— Зачем современному зоологу методы молекулярной биологии?
— Чем размножение моллюсков отличается от большинства остальных животных?

У нас в гостях Мария Сказина, зоолог из Санкт-Петербургского государственного университета.

➜ Apple Podcasts
➜ Google Podcasts
➜ Яндекс Музыка
➜ Другие платформы
➜ Слушать на сайте

Новый выпуск. Не про вакцины и вирусы!!! Но про рак у моллюсков

я как раз сейчас прохожу курс по пайтону, ну типа база синтаксиса, пандас, вот это вот всё. если подтянусь за два месяца и если у вас там френдли относятся к тупырям типа меня - я бы очень хотела поучаствовать. всегда хотела на хакатон по биоинформатике, потому что в целом хочу в биоинформатику, но страшно)))

чет я сейчас подумала, что меня конечно как-то перемолотило за эти три года... боюсь участвовать, боюсь писать кому-то. на первом курсе такая борзая была... эх

Бояться участвовать в онлайн хакатоне не стоит, ну что они сделают даже если вы в компьютер не умеете, напишут жалобу в ООН? :) надо подаваться в любом случае, а дальше разберетесь, даже если вы в итоге не придете никто вас ругать не будет

В крайнем случае поможешь презентацию сделать и посмотришь что другие умеют и как подходят. Это реально крутая возможность, и не повод сидеть в темном углу!

В Москве закончилась эпиваккорона, запись на прививку остановлена. Ой как печально :(((

вот презентации я классные делаю)))

значит решено!) спасибо за возможность

Не за что :) там очень добрые и терпеливые менторы, они сейчас всякие семинары дают на той же платформе, когда будете готовы можете посмотреть :)

А это те же ребята, которых ты в прошлом году рекламировал?

Always, я был в команде с 2016го до 2020го

Так а в прошлом году по итогу получилось что-нибудь провести?

Онлайн было, больше похоже на конфу, несколько дней всего, я смотрел