T
а зачем отбирать у народа возможности к самопросвещению? Вы не правильный вопрос ставите. Правильный вопрос не "зачем", а "для чего". Cui prodest, так сказатЬ, как завещал наш великий Вождь, батюшка Ленин. Если Вы понимаете, о чём я.
Size: a a a
2021 July 01
T
ого, на даад я, например, хочу... страшно 😳 что будет через пару лет
PV
будет то же самое, и еще через пару))
лягушку варят медленно
лягушку варят медленно
T
надо выпускаться скорее, а то я тоже что-то медленно варюсь
OK
Мне кажется, этим летом мудро все проводить онлайн
АР
У меня не получилось найти ничего лучше, чем cosmic. Но в нем перестройки записаны в виде слияний экзонов.
К сожалению, в нем далеко не все.
Я обычно из статей беру информацию о местах слияния, но тут всегда есть риск попасть на неправильный транскрипт. Далеко не всегда про это есть информация.
Нашел сейчас, не знаю, почему раньше не попадалась Fusion GDB https://ccsm.uth.edu/FusionGDB/index.html
К сожалению, в нем далеко не все.
Я обычно из статей беру информацию о местах слияния, но тут всегда есть риск попасть на неправильный транскрипт. Далеко не всегда про это есть информация.
Нашел сейчас, не знаю, почему раньше не попадалась Fusion GDB https://ccsm.uth.edu/FusionGDB/index.html
AM
Спасибо большое за совет! Буду искать.
Е
Записала!
T
а насколько для начинающих?.. 🥺👉🏻👈🏻
G
Уметь написать скрипт на питоне и баше нужно :) умения писать алгоритм Кнута Морриса Пратта или выравнивание - не нужно. 25 решенных задачек на розалинд достаточно, условно говоря
MF
Т.е неначинающим подаваться не стоит? )
G
Если вы не работали с одним из перечисленных видов данных, но хотите - стоит. Если вы уже написали 5 статей по анализу транскриптомов и больше интересных для вас тем на хакатоне нет - точно не стоит, ваша квалификация вообще не улучшится, просто потратите время
MF
Понятно, спасибо)
G
У нас вряд ли получится достать реально новые данные, то есть статьи по итогам ну хз, один раз статья по итогам очного хакатона вышла, но там же секвенировали нанопорой и был и вет лаб и драй лаб
АК
Всем привет
А я с очень дилетантским вопросом
Никто не может помочь понять, как строится дизайн эксперимента в секвенировании? Нужны ли повторности?
Задача: определить секвенированием количество различных молекул миРНК (будут сравниваться изменения в экспрессии с контрольной группой)
В гугле не забанили, но вопрос горящий, поэтому спрашиваю совета людей параллельно с поиском литературы
А я с очень дилетантским вопросом
Никто не может помочь понять, как строится дизайн эксперимента в секвенировании? Нужны ли повторности?
Задача: определить секвенированием количество различных молекул миРНК (будут сравниваться изменения в экспрессии с контрольной группой)
В гугле не забанили, но вопрос горящий, поэтому спрашиваю совета людей параллельно с поиском литературы
IF
Повторности нужны
АК
Спасибо. А какое их количество принято в качестве оптимального, не подскажете?)
IF
Чем больше, тем лучше. Конкретно про миРНК не скажу. Обычно делают 3, насколько я знаю, но лучше больше для лучшей статистики.
VS
Можно рассчитать, какая нужна точность оценки среднего
VS
Можно взять 3 измерения, но получить широченный доверительный интервал, можно 10 и лучше понять, где находится «истинное среднее»