В некоторых занимаются. Я работал в такой

Просто ты в "неправильном" айти работал. Правда, у людей из яндекса тоже нервный тик при словах "заполнение бэклога" начинался😅😅😅

ноучный вопрос к господам-биоинформатикам - у меня есть VCF файл с миллионом вариков, мне нужно прогенотипировать тыщу полных геномов по этому VCF, чем это сделать? вариант коллинг делать не хочу, VCFки оттуда доставать тоже, генотипировать хочу (глубина аллелей A и B буквально), инделей (хахаха обожаю этот перевод) нет - наш тул почему-то выдает миллиард IO операций и мне сказали шарманку закрыть, поэтому ищу что-то быстрое и разумное по IO

Привет! Есть ли тут те, кто работает в Химраре? Хочется с вами поговорить)

А полные геномы - это просто наборы ридов?

да, сорри, BAM-файлы с результатами WGS

Всем привет. Кто-нибудь здесь защищался в TU Dresden в аспе?

Богдан который анти-аброад андерхуд сейчас там как минимум учился в аспе

https://twitter.com/antiabroadunde1

Он и в этом чате недавно появлялся @krlnk

О боже нашу маму и тут и там показывают

Спасибо, спрошу его

Я там была в комиссии, если это актуально

Пока ещё не защитился, хоть и сдал диссер в мае. 😡😡😡

Впрочем, есть те кто с февраля в неопределенности.

Жиза жизненная😅

Всем привет! А есть граждане РБ, которые устраивались работать в РФ? Что служит в качестве ИНН и ПСС?

Продублирую вопрос про флуоресцентные белки: кто-нибудь работал с флуоресцентными белковыми метками маленького размера (до 12-15 кДа)? У меня маленький белок, чью локализацию в клетке очень хочется посмотреть, но GFP влияет на конформацию белка интереса. Ищу либо альтернативу GFP, либо методу определения локализации (антител к белку нет).

dTomato мы пользовались, вроде небольшой если память не изменяет

EGFP хорош, лучше него для этой цели вряд ли что-то найдётся. Может быть линкер между белком интереса и меткой поварьировать? Или конец поменять (N- vs C-)? tdTomato большой.

Какие симптомы "изменения конформации белка интереса"?

1. HaloTag - его точно использовали для single cell трэкинга отдельных молекул в хроматине (даже для гистонов, а они маленькие))
2. NanoLuc
3. NanoFAST (отечественное) https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/sc/d1sc01454d