это потому что в ubuntu на стандартном ядре тестируют сборку dkms zfs, а если захочется нестандартного ядра? да и ждать компиляции сомниетлньо. Также сомнительно работать с ФС в обход VFS API
Если хочется не стандартного ядра, то у вас дрочево будет со всеми dkms пакетами и вы сами выбрали себе такую боль. zfs тут не причем, это надо решить для себя нужно вам кастомное ядро или нет и готовы ли вы заниматься проблемами которые выходят из этого или нет. Выбор каждого.
Кастомное ядро ещё и собрать надо, это не более сильное дрочево?