поддомены имеет смысл делать под яндекс, если на каждый запилить свой вебмастер и тогда все должно работать. Подпапки- общий вес передается подпапкам. Но насколько я знаю- это мало эффективно. Просто вы не замечаете миграцию трафика с кировского урла на московский и в выдаче не замечате кировского поддомена по запросу продаю товар в москве.)
Потому что как минимум это будет человека путать, плюс я не уверен насколько хорошо ПС такое воспримет, не говоря уже о том, что с точки зрения внутряка так делать - это костыли. Да и я вот сторонник множественных хлебных крошек при такой реализации