тогда у вас один вариант..Писать запрос который пойдет и по каждой ячейке ;) будет переносить данные в другую табличку с такой же структурой по дороге конвертируя во что то единое (во временной табле, к примеру)
ну вот так мои бойцы и сделали в QGIS.. сделали врем таблу с нормальной кодировкой - потом апдейт по ней исходной..
я бы загнал все в postgree в двух экземплярах - потом прошелся бы скриптом со сливом во временный запрос, потом в физ таблицу.