Но вообще, я бы вынес бы вот этот каталог config и настройку, а сделал бы yiisoft-recipes, и допилил бы плагин композера, чтобы он при установке/обновлении пакета, преверял бы наличие рецепта, если есть, то получал бы его, брал бы из него настройки и конфиги и мержил. Таким образом мы бы могли интегрировать любой сторонний пакет, позволив его автоматом подключить к приложению.
И вот над этим тоже подумай. Смысл тот же, что и в симфони, но организовать можно немного по-другому.