А вот тут ФСТЭК сама себя загнала а ловушку :)
Медицинская организация, если она подведомстаенна здраву, обязана согласовывать перечень объектов с здравом. Если Минздрав выпустил документ, в котором говорится, что что-то не является объектом КИИ, то организация обязана этим мнением руководствоваться. ФСТЭК может соглашаться, ФСТЭК может не соглашаться (хотя в силу того же ПП127 у ФСТЭК нет опции "не согласиться с перечнем") - медицинскую организацию мнение ФСТЭК по этому поводу волновать не должно: все вопросы к вышестоящим.
Тут да. Но, не все мед учреждения согласовывают с здравом (муниципальные учреждения хоть и здрав но относятся к муниципалитету. И здрав и фстэк (в нашем регионе) дали информацию о том что им согласовать не надо в здраве, в противовес гуз-ам-они через здрав). Но все учреждения исполняют требования здрава :). Поэтому, да, что хочет здрав, то и должны исполнять учреждения и регулятор тут помехой быть не может.