за счет того, что в региональных перевозках почти нет конкуренции, билеты обычно стоят жирно
пример такой перевозки (хотя может и не оч удачный) - рейс северстали из череповца в дме, на 126 поезде можно ездить дешевле и не тратить время светового дня на перемещение
Тут ещё проблема, что гонять самолёт в принципе дорого, не зависимо от размера. Кроме топлива там всякие аэропортовые сборы, зарплаты и прочее. В итоге, билет на одного пассажира выходит дороже, чем на большом самолёте.