сейчас делаю простыню variables c паттернами типа <env>_<name>, чтоб удобно было думаю перейти на .env файлы в приложении, генерируемые consul-template из consul и vault, чтоб gitlab ci репы с приложениием вообще отношения к конфигам приложения не имел на первом этапе, а на втором следил за обновлением шаблонов и конфигов consul-template для приложения и передеплоивал только их при изменении